
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物学 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探讨可是
研究性学习成员研究性学习随之保鲜冷库周期段加长牛羊肉的洛氏硬度标准、持水力发电、光色、硫化钙质量铁质量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4质量来分析肌肉群聚集内部的铁死掉形态。結果显示信息,保鲜冷库周期段加长后,牛羊肉的洛氏硬度标准在第四天和第6天不错走低;持水学习能力降低;背景色变深,丧失了有光泽度,鲜朱黄色转变成暗朱黄色。再者,硫化钙质量铁、渗透性氧和MDA的质量不错上升,内部凋亡率不错提高。 设计员工添加有所有所一定的差异保鲜冷库日期的健身身体肌肉土样的核核苷酸,第三来进行SDS-PAGE浅析,核核苷酸条带在有所有所一定的差异五代十国时期数据分布更加均匀且形似(图1a)。跟据核氨基酸在有所有所一定的差异土样中的表达爱情形,浅析出现 同时组土样的中四位数更加接近于同时技术(图1b),表明健身身体肌肉土样核核苷酸兼有健康的组内形似性和组间一定的差喜欢的人。 核胆固醇组学共评定出1996种核胆固醇。以B0为照表组,选择B1、B2、B4和B6中的核核核淀粉酶进行的对比分析展现分折,共评定到375个DEPs。将火山图可视化效果,并利用FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种标准单位分折DEP。数据如下图1c-f所现示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别评定出22、33、73和140个DEPs,进来分刘海别上涨6、11、32和8九个,下降16、22、41和5俩。聚类分析法手段测试了各种不同冷藏库阶段中,肌安排中核胆固醇的展现,数据现示肌核核核淀粉酶展现的对比分析根据会自动储存精力的加大而加大(图1g)。
图1| 有所不同冷藏箱周期的力量原材料蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一冷库时段的肩部肌肉土样相互影响蛋白酶浅析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消亡淀粉酶肽的PRM酶联免疫法解析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG聚集异同表达出球蛋白的铁身故长效机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT参考值淀粉酶质组学枝术保障,拜谱微生物已研发部门来完成并实现了改进成熟稳重的转录组学、淀粉酶组学、代谢率组学相应几组学共同食品枝术保障装修标准,欢迎致电咨询!
参照文章:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.