
近日,长沙医科院校一是复属医阮王学浩教授技术团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向治疗能量转换代谢转化检测分析服务。
英文版名称:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客服企业:南京医科大学
科学研究原料:细胞
拜谱提高服务培训:转录组测序+蛋白酶互作组+靶点势能新陈代谢组
技艺路径:
学习但是
01、YBX1被鉴别为HCC中糖酵解的的关键表观遗传
本调查收集HCC肺部肉瘤样板(n=7)的单人体生殖细胞膜RNA测序的数据表格集做好概述一下,知道糖酵解几丁质酶大部分分布在肺部肉瘤人体生殖细胞膜中,hdWGCNA概述一下判断出9个什么是基因方案(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的求生概述一下选定YBX1为孤立求生问题各种因素(图1H)。更深层次的骤紧密结合IHC、WB调查和肺部肉瘤策划 与领近非肺部肉瘤策划 的面积转录组学的数据表格集确认YBX1是肝人体生殖细胞膜癌方法的存在靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判断为转换HCC上皮细胞糖酵解的重点问题
02、YBX1加速HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点体力代谢转化组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1运用并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密联系并推进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提高其磷碱化,最终得以可以淡化其核转位
进步检查YBX1的O-GlcNAc糖基化能不能干扰其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC人体神经细胞中或用OGT阻止剂OSMI-1净化办理,YBX1核蛋清酶能力重要减小,YBX1磷酸性反应重要抑制(图4A-C)。IP实验英文出现,在一模一样的Flag-YBX1底物能力下,YBX1-WT的磷酸性反应能力重要远远超出YBX1-T57A,表示磷酸性反应的增长不禁仅是所以极高的YBX1核蛋清酶展示(图4D)。分割了核和质类物质会找到了TMG净化办理的HCC人体神经细胞中YBX1核展示的身高(图4E-F),进步会找到了YBX1磷酸性反应的关键所在设定成分是AKT(图4G-I)。许多会找到了更加注重O-GlcNAc糖基化用利于其磷酸性反应来不断增强YBX1核蛋清酶稳定的性并利于核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰优势于其深化一个脚印情况磷硝化作用装饰并才能有利于促进其核转位
05、YBX1可以淡化PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1利于PKM2转录
06、YBX1 能增长组核蛋白乳过酸遮盖平均水平
调查感觉YBX1敲低相关系数大幅度拉低球营养物质乳硝化为用,十分是H3K18乳硝化为用(图6A-C)。糖酵解抑止剂2-DG的实验所核实了糖酵解与组球血清乳硝化为用的真接微信关联,抑止糖酵解可相关系数大幅度拉低H3K18la关卡(图6D)。PKM2过表明可逆转转YBX1敲低引致的H3K18la走低,之外源乳酸治理 不单上升H3K18la,还随YBX1表明调整,表示会存在顺向调查问卷(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR核实,H3K18la利用丰度于YBX1进行子真接可以淡化其转录,该历程受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),并感觉P300 调整是YBX1强化H3K18乳酰化为用的体系(图6K-L)。
图6.YBX1怎强H3K18乳酸性反应装饰关卡
一篇文章总结
在这些学习中新闻稿了YBX1在HCC中高呈现出,有时候与糖酵解秘切关于。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,才能动态平衡蛋清质并加强其呈现出。种绘制还促使YBX1在T57处的磷过酸,促使其核易位。之所以,这样的过程 增强学习了糖酵解关于染色体遗传的转录并伤害性乳酸的形成。再者,YBX1成功激活P300的转录,接着驱动软件组蛋清的乳过酸,非常是H3K18la,H3K18乳过酸同向控制YBX1染色体遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因正反两面馈环措施图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向药物能力分解组技术服务,拜谱生物工程建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、翻意后体现组学、产生组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考选取论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.